Tesi magistrale
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138 lines
4.3 KiB

  1. \documentclass[12pt,twoside,openright]{report}
  2. % ===== PAGE LAYOUT
  3. \usepackage[a4paper,width=150mm,top=25mm,bottom=25mm]{geometry}
  4. \usepackage[utf8]{inputenc}
  5. \usepackage{fancyhdr}
  6. \pagestyle{fancy}
  7. \renewcommand{\headrulewidth}{2pt}
  8. \fancyhf[lh,rh,ch]{}
  9. \fancyhf[leh]{\leftmark}
  10. \fancyhf[roh]{\rightmark}
  11. %\usepackage{titlesec}
  12. %\newcommand{\sectionbreak}{\clearpage}
  13. % ===== LANGUAGE
  14. \usepackage[italian]{babel}
  15. % ===== FIGURES AND CAPTIONS
  16. \usepackage{graphicx}
  17. \graphicspath{ {images/} }
  18. \usepackage{caption}
  19. \captionsetup[figure]{font=small,labelfont=bf}
  20. \captionsetup[table]{font=small,labelfont=bf}
  21. \usepackage{subcaption}
  22. % ===== MATHS
  23. \usepackage{amsmath}
  24. \let\vec\mathbf
  25. \let\Re\relax
  26. \DeclareMathOperator{\Re}{Re}
  27. \usepackage[version=4]{mhchem}
  28. % ===== TABLES
  29. \usepackage{booktabs}
  30. \usepackage{rotating}
  31. % ===== TEXT FONTS
  32. \usepackage{anyfontsize}
  33. \usepackage{xcolor}
  34. \usepackage{siunitx}
  35. \sisetup{retain-unity-mantissa = false,
  36. list-final-separator = { e },
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  40. range-phrase = --,
  41. range-units = single}
  42. % ===== BIBLIOGRAPHY
  43. \usepackage{cite}
  44. % ===== PROTOCOLS
  45. \usepackage{algorithm}
  46. \usepackage{algorithmic}
  47. \makeatletter
  48. \renewcommand{\ALG@name}{Protocollo}
  49. \makeatother
  50. % ===== LINKS
  51. \usepackage{hyperref}
  52. \title{Master Thesis}
  53. \author{Lorenzo Zolfanelli}
  54. \date{April 2020}
  55. \begin{document}
  56. \pagestyle{empty}
  57. \input{titlepage}
  58. \newgeometry{width=150mm,top=25mm,bottom=25mm}
  59. \pagestyle{fancy}
  60. \setlength{\headheight}{15pt}
  61. \chapter*{Abstract}
  62. \selectfont
  63. Alcuni meccanismi fondamentali per la comprensione del funzionamento
  64. dei tessuti e degli organismi multicellulari sono ancora largamente
  65. incompresi. In particolare la meccanotrasduzione, ovvero la
  66. traduzione di stimoli e sollecitazioni meccaniche in segnali
  67. biochimici, è un fenomeno di fondamentale importanza per molte
  68. funzioni critiche degli organismi viventi, come quelle responabili
  69. dell'organizzazione e dell'equlibrio dei tessuti cellulari. La
  70. meccanotrasduzione ha origine dall'interazione tra due o più proteine
  71. che, modificando in base alle sollecitazioni esterne le proprie
  72. caratteristiche conformazionali, possono modulare loro attività in
  73. funzione dell'ambiente meccanico circostante. In questo lavoro di tesi
  74. viene proposto l'utilizzo di tecniche laser avanzate per la
  75. caratterizzazione di questi meccanismi di interazione. Viene descritta
  76. la realizzazione di un apparato sperimentale adatto a misurare e
  77. quantificare la cinetica di legame tra le proteine coinvolte al
  78. variare della forza applicata su esse. Per questo scopo viene
  79. implementato un sistema in grado di applicare una forza controllata
  80. con estreme precisione su singole molecole biologiche, sfruttando le
  81. proprietà dell'interazione tra radiazione-materia e in particolare la
  82. possibilità di intrappolare otticamente microsfere dielettriche usando
  83. un fascio gaussiano altamente focalizzato. Un elemento di particolare
  84. novità che caratterizza l'apparato realizzato è la combinazione di
  85. tecniche di spettroscopia di forza con tecniche di imaging di singola
  86. molecola: in questo modo viene proposto un metodo per analizzare
  87. contemporeanamente l'interazione di più di due proteine per volta - ad
  88. esempio osservando la presenza di eventuali altri co-fattori legati e
  89. misurando come essi possano modificare l'interazione studiata.
  90. Utilizzando fasci di luce inclinati o l'onda evanescente prodotta in
  91. caso di riflessione interna totale è possibile rivelare co-fattori
  92. marcati con sonde fluorescente in prossimità delle proteine
  93. studiate. Correlando temporalmente le informazioni sulla
  94. localizzazione dei co-fattori con le cinetiche di interazione
  95. acquisite a forza costante è possibile andare a caratterizzare più
  96. completamente meccanismi di meccanotrasduzione come quelli
  97. responsabili dell'adesione tra le cellule nei tessuti degli orgaanismi
  98. viventi, in un'ambientazione estremamente controllata dove il tipo
  99. e il numero di elementi interagenti è esattamente determinato.
  100. \tableofcontents
  101. \input{chapters/1-introduction}
  102. \input{chapters/2-setup}
  103. \input{chapters/3-methods}
  104. \input{chapters/4-results}
  105. %\input{setup-fig/fig1}
  106. \appendix
  107. \input{chapters/A1-AJ_network}
  108. \input{chapters/A2-electronics}
  109. \input{chapters/A3-protocols}
  110. \bibliography{references.bib}{}
  111. \bibliographystyle{plainurl}
  112. \end{document}