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chapters/1-introduction.tex

@@ -503,13 +503,14 @@ seguenti effetti:
 Grazie alla termodinamica statistica è possibile mettere in relazione
 lo spettro delle fluttuazioni di posizione di una sfera intrappolata
 con il parametro $k$ della forza elastica di richiamo
-(vedi Appendice \ref{}).
+(vedi Appendice \ref{app:fluctuaction_spectrum}).
 In questo modo, una volta determinato $k$, è possibile mettere
 in relazione il valore delle forze esterne agenti sulla sfera con il
 suo spostamento dalla posizione di riposo.
 
 
 \section{Microscopia di fluorescenza di singola molecola}
+\label{sec:fluo}
 
 Tipicamente, le tecniche di microscopia di fluorescenza di singola
 molecola consentono di sondare la posizione e i movimenti di singole
@@ -613,4 +614,23 @@ di tutti gli emettitori che si trovino su piani diversi attraversati
 dal fascio.
 In campioni con una elevata densità di fluorofori liberi in soluzione
 questo effetto viene particolarmente accentuato, con un effetto
-negativo sul rapporto segnale/rumore ottenibile.
+negativo sul rapporto segnale/rumore ottenibile e di conseguenza
+sulla possibilità di individuare e localizzare singole molecole.
+
+Per ottenere una sensibilità di singola molecola senza scarificare
+la risoluzione temporale sono state sviluppate tecniche che,
+manipolando il fascio di eccitazione, consentono di ridurre lo
+spessore del volume di campione eccitato, come la microscopia a
+riflessione interna totale
+(TIRF, \textit{Total Interal Reflection Fluorescence microscopy})
+o quella a fogli di luce inclinati
+(HILO, \textit{Highly Inclined and Laminated Optical sheet
+microscopy}).
+Grazie a queste due tecniche è possibile ottenere una sensibilità
+di singola molecola a una risoluzione temporale nell'ordine dei
+millisecondi, rendendo possibile ad esempio il tracciamento
+degli spostamenti di una proteina.
+
+\subsection{TIRF}
+
+

chapters/2-methods.tex

@@ -1,5 +1,6 @@
  %%%%%%%%% %%%%%%%%% %%%%%%%%% %%%%%%%%% %%%%%%%%% %%%%%%%%% %%%%%%%%%
 \chapter{Metodi}
+\label{cap:methods}
 
 \section{Force-clamp}
 

chapters/A1-AJ_network.tex

@@ -3,5 +3,5 @@
     \includegraphics[width=1.0\textwidth]{images/map04520.png}
     \caption{\textbf{Giunzioni aderenti:} mappa delle interazioni molecolari attualmente note, fornita dal progetto
     KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) \cite{10.1093/nar/28.1.27,10.1093/nar/gky962,doi:10.1002/pro.3715}}
-    \label{fig:setup}
+    \label{fig:network_aj}
 \end{sidewaysfigure}