From 4e9415e7c8b5026132ae661000374be773fa9bcc Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: "lorenzo.zolfanelli93" <lorenzo.zolfanelli93@gmail.com>
Date: Thu, 13 Aug 2020 20:25:51 +0000
Subject: [PATCH] Update on Overleaf.

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 chapters/1-introduction.tex | 24 ++++++++++++++++++++++--
 chapters/2-methods.tex      |  1 +
 chapters/A1-AJ_network.tex  |  2 +-
 3 files changed, 24 insertions(+), 3 deletions(-)

diff --git a/chapters/1-introduction.tex b/chapters/1-introduction.tex
index 06ae4be..17c53db 100644
--- a/chapters/1-introduction.tex
+++ b/chapters/1-introduction.tex
@@ -503,13 +503,14 @@ seguenti effetti:
 Grazie alla termodinamica statistica è possibile mettere in relazione
 lo spettro delle fluttuazioni di posizione di una sfera intrappolata
 con il parametro $k$ della forza elastica di richiamo
-(vedi Appendice \ref{}).
+(vedi Appendice \ref{app:fluctuaction_spectrum}).
 In questo modo, una volta determinato $k$, è possibile mettere
 in relazione il valore delle forze esterne agenti sulla sfera con il
 suo spostamento dalla posizione di riposo.
 
 
 \section{Microscopia di fluorescenza di singola molecola}
+\label{sec:fluo}
 
 Tipicamente, le tecniche di microscopia di fluorescenza di singola
 molecola consentono di sondare la posizione e i movimenti di singole
@@ -613,4 +614,23 @@ di tutti gli emettitori che si trovino su piani diversi attraversati
 dal fascio.
 In campioni con una elevata densità di fluorofori liberi in soluzione
 questo effetto viene particolarmente accentuato, con un effetto
-negativo sul rapporto segnale/rumore ottenibile.
\ No newline at end of file
+negativo sul rapporto segnale/rumore ottenibile e di conseguenza
+sulla possibilità di individuare e localizzare singole molecole.
+
+Per ottenere una sensibilità di singola molecola senza scarificare
+la risoluzione temporale sono state sviluppate tecniche che,
+manipolando il fascio di eccitazione, consentono di ridurre lo
+spessore del volume di campione eccitato, come la microscopia a
+riflessione interna totale
+(TIRF, \textit{Total Interal Reflection Fluorescence microscopy})
+o quella a fogli di luce inclinati
+(HILO, \textit{Highly Inclined and Laminated Optical sheet
+microscopy}).
+Grazie a queste due tecniche è possibile ottenere una sensibilità
+di singola molecola a una risoluzione temporale nell'ordine dei
+millisecondi, rendendo possibile ad esempio il tracciamento
+degli spostamenti di una proteina.
+
+\subsection{TIRF}
+
+
diff --git a/chapters/2-methods.tex b/chapters/2-methods.tex
index 83646ce..d001cdd 100644
--- a/chapters/2-methods.tex
+++ b/chapters/2-methods.tex
@@ -1,5 +1,6 @@
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 \chapter{Metodi}
+\label{cap:methods}
 
 \section{Force-clamp}
 
diff --git a/chapters/A1-AJ_network.tex b/chapters/A1-AJ_network.tex
index 6aa6c55..8356a84 100644
--- a/chapters/A1-AJ_network.tex
+++ b/chapters/A1-AJ_network.tex
@@ -3,5 +3,5 @@
     \includegraphics[width=1.0\textwidth]{images/map04520.png}
     \caption{\textbf{Giunzioni aderenti:} mappa delle interazioni molecolari attualmente note, fornita dal progetto
     KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) \cite{10.1093/nar/28.1.27,10.1093/nar/gky962,doi:10.1002/pro.3715}}
-    \label{fig:setup}
+    \label{fig:network_aj}
 \end{sidewaysfigure}
\ No newline at end of file