Tesi magistrale
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179 lines
5.3 KiB

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\chapter{Apparato sperimentale}
\label{cap:methods}
L'apparato sperimentale consiste in un microscopio inverito, montato
\section{Force-clamp}
In figura \ref{fig:setup} è mostrato uno schema integrale
dell'apparato realizzato.
Le componenti principali sono descritte nella sezione \ref{sec:setup}.
Successivamente, nella sezione \ref{sec:stabilization} è descritto il
sistema di stabilizzazione meccanica introdotto per compensare lo
spostamento
del campione dovuto a deriva termica e oscillazioni acustiche.
Nella sezione \ref{sec:calibration} è descritta nel dettaglio la
procedura usata per la calibrazione dei parametri delle trappole
ottiche.
L'esperimento tipico utilizzato per studiare l'interazione tra una
proteina e un microfilamento di actina consiste in un saggio a tre
sfere, o \textit{3-beads assay}. I dettagli per la realizzazione di
questo esperimento sono illustrati nella sezione \ref{sec:3beads}.
\section{Apparato sperimentale}
\label{sec:setup}
L'apparato sperimentale è stato realizzato presso i laboratori del
LENS, sulla base dell'apparato utilizzato in precedenza dal di
Biofisica di Singola Molecola per lo studio delle interazioni tra
miosina e filamenti di actina e repressori della trascrizione
e filamenti di DNA.
L'apparto si compone di N parti principali:
\begin{description}
\item[Pinzette ottiche:] Una coppia di fasci gaussiani a \SI{1064}{\nm}, ottenuti da un laser a stato solido,
\end{description}
\begin{sidewaysfigure}
\includegraphics[width=1.0\linewidth]{images/Setup.pdf}
\caption{Caption}
\label{fig:setup}
\end{sidewaysfigure}
\begin{sidewaystable}
\centering
\begin{tabular}{>{\tt}l l l >{\it}l l}
\toprule
Code & Type & Usage & Parameters & Product ID\\
\midrule
\multicolumn{5}{l}{\it Fluorescence Excitation Path}\\
F-Clean635
& Bandpass Filter
& \SI{635}{\nm} laser clean-up
& $\lambda_{centr}: \SI{640}{\nm},
bw: \SI{14}{\nm}$
& FF01-640/14-25\\
L-TS1a
& Plano-Convex Spherical Lens
& Telescope for \SI{635}{\nm} laser
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
L-TS1b
& &
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
L-TS2a
&
& Telescope for \SI{488}{\nm} laser
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
L-TS2b
& &
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
DIC-532
& Single-edge Dichroic Filter
& Excitation beam multiplexing
& $\lambda_{edge}: \SI{532}{\nm}$
& Di02-R532-25-D\\
DIC-488
& &
& $\lambda_{edge}: \SI{488}{\nm}$
& Di02-R488-25-D\\
L-TS3a
& Achromatic Doublet
& Telescope for comb. ex. lasers
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
L-TS3b
& &
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
L-Exc
&
& Excitation beam focusing
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
DIC-Fluor
& Quad-edge Dichroic Filter
& Excitation/Emission separation
& $\lambda_{edge}: \SIlist{405;488;532;635}{\nm}$
& Di03-R405/488/532/635-t1 \\
\multicolumn{5}{l}{\it Tweezers Path}\\
L-TS4a
& Plano-Convex Spherical Lens
& Telescope matching isolator size
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
L-TS4b
& &
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
L-TS5a
& Plano-Convex Spherical Lens
& Telescope after isolator
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
L-TS5b
& &
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
L-Twz1
& Plano-Convex Spherical Lens
& Telescope after isolator
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
L-Twz2
& &
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
DIC-Twz1
& Single-edge Dichroic Filter
& Tweezer beam insertion
& $\lambda_{edge}: \SI{1064}{\nm}$
& \\
\multicolumn{5}{l}{\it Imaging Path}\\
L-Im1
& Tube Lens
& Tube Lens
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
L-Im2
& Imaging Lens
& Imaging Lens
& f: \SI{0}{\mm}
& \\
DIC-BF
& Single-edge Dichroic Filter
& Fluorescence/Brightfield demux
& $\lambda_{edge}: \SI{705}{\nm}$
& FF705-Di01-25x36\\
F-BlockBF
& Shortpass Filter
& Residual brightfield suppression
& $\lambda_{cut}: \SI{700}{\nm}$
& FESH0700\\
F-Emiss
& Quad-band bandpass Filter
& Fluorophore emission filtering
& $\lambda_{centr}: \SIlist{446;510;581;703}{\nm}$
& FF01-446/510/581/703\\
F-BlockTwz
& Bandstop filter
& Fluorophore emission filtering
& $\lambda_{centr}: \SIlist{446;510;581;703}{\nm}$
& FF01-446/510/581/703\\
\end{tabular}
\caption{Caption}
\label{tab:my_label}
\end{sidewaystable}
\section{Stabilizzazione meccanica}
\label{sec:stabilization}