Tesi magistrale
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156 lines
4.8 KiB

  1. %%%%%%%%% %%%%%%%%% %%%%%%%%% %%%%%%%%% %%%%%%%%% %%%%%%%%% %%%%%%%%%
  2. \chapter{Metodi}
  3. In figure \label{fig:setup} è mostrato uno schema integrale dell'apparato realizzato.
  4. Le componenti principali sono descritte nella sezione \ref{sec:setup}.
  5. Successivamente, nella sezione \ref{sec:stabilization} è descritto il sistema di stabilizzazione meccanica introdotto per compensare lo spostamento
  6. del campione dovuto a \textit{drift} termico e oscillazioni acustiche.
  7. Nella sezione \ref{sec:calibration} è descritta nel dettaglio la procedura
  8. usata per la calibrazione dei parametri delle trappole ottiche.
  9. L'esperimento tipico utilizzato per studiare l'interazione tra una proteina
  10. e un microfilamento di actina consiste in un saggio a tre sfere, o \textit{3-beads assay}. I dettagli per la realizzazione di questo
  11. esperimento sono illustrati nella sezione \ref{sec:3beads}.
  12. \section{Apparato sperimentale}
  13. \label{sec:setup}
  14. L'apparato sperimentale è stato realizzato presso i laboratori del LENS,
  15. sulla base dell'apparato utilizzato in precedenza dal gruppo di
  16. \begin{sidewaysfigure}
  17. \includegraphics[width=1.0\linewidth]{images/Setup.pdf}
  18. \caption{Caption}
  19. \label{fig:setup}
  20. \end{sidewaysfigure}
  21. \begin{sidewaystable}
  22. \centering
  23. \begin{tabular}{>{\tt}l l l >{\it}l l}
  24. \toprule
  25. Code & Type & Usage & Parameters & Product ID\\
  26. \midrule
  27. \multicolumn{5}{l}{\it Fluorescence Excitation Path}\\
  28. F-Clean635
  29. & Bandpass Filter
  30. & \SI{635}{\nm} laser clean-up
  31. & $\lambda_{centr}: \SI{640}{\nm},
  32. bw: \SI{14}{\nm}$
  33. & FF01-640/14-25\\
  34. L-TS1a
  35. & Plano-Convex Spherical Lens
  36. & Telescope for \SI{635}{\nm} laser
  37. & f: \SI{0}{\mm}
  38. & \\
  39. L-TS1b
  40. & &
  41. & f: \SI{0}{\mm}
  42. & \\
  43. L-TS2a
  44. &
  45. & Telescope for \SI{488}{\nm} laser
  46. & f: \SI{0}{\mm}
  47. & \\
  48. L-TS2b
  49. & &
  50. & f: \SI{0}{\mm}
  51. & \\
  52. DIC-532
  53. & Single-edge Dichroic Filter
  54. & Excitation beam multiplexing
  55. & $\lambda_{edge}: \SI{532}{\nm}$
  56. & Di02-R532-25-D\\
  57. DIC-488
  58. & &
  59. & $\lambda_{edge}: \SI{488}{\nm}$
  60. & Di02-R488-25-D\\
  61. L-TS3a
  62. & Achromatic Doublet
  63. & Telescope for comb. ex. lasers
  64. & f: \SI{0}{\mm}
  65. & \\
  66. L-TS3b
  67. & &
  68. & f: \SI{0}{\mm}
  69. & \\
  70. L-Exc
  71. &
  72. & Excitation beam focusing
  73. & f: \SI{0}{\mm}
  74. & \\
  75. DIC-Fluor
  76. & Quad-edge Dichroic Filter
  77. & Excitation/Emission separation
  78. & $\lambda_{edge}: \SIlist{405;488;532;635}{\nm}$
  79. & Di03-R405/488/532/635-t1 \\
  80. \multicolumn{5}{l}{\it Tweezers Path}\\
  81. L-TS4a
  82. & Plano-Convex Spherical Lens
  83. & Telescope matching isolator size
  84. & f: \SI{0}{\mm}
  85. & \\
  86. L-TS4b
  87. & &
  88. & f: \SI{0}{\mm}
  89. & \\
  90. L-TS5a
  91. & Plano-Convex Spherical Lens
  92. & Telescope after isolator
  93. & f: \SI{0}{\mm}
  94. & \\
  95. L-TS5b
  96. & &
  97. & f: \SI{0}{\mm}
  98. & \\
  99. L-Twz1
  100. & Plano-Convex Spherical Lens
  101. & Telescope after isolator
  102. & f: \SI{0}{\mm}
  103. & \\
  104. L-Twz2
  105. & &
  106. & f: \SI{0}{\mm}
  107. & \\
  108. DIC-Twz1
  109. & Single-edge Dichroic Filter
  110. & Tweezer beam insertion
  111. & $\lambda_{edge}: \SI{1064}{\nm}$
  112. & \\
  113. \multicolumn{5}{l}{\it Imaging Path}\\
  114. L-Im1
  115. & Tube Lens
  116. & Tube Lens
  117. & f: \SI{0}{\mm}
  118. & \\
  119. L-Im2
  120. & Imaging Lens
  121. & Imaging Lens
  122. & f: \SI{0}{\mm}
  123. & \\
  124. DIC-BF
  125. & Single-edge Dichroic Filter
  126. & Fluorescence/Brightfield demux
  127. & $\lambda_{edge}: \SI{705}{\nm}$
  128. & FF705-Di01-25x36\\
  129. F-BlockBF
  130. & Shortpass Filter
  131. & Residual brightfield suppression
  132. & $\lambda_{cut}: \SI{700}{\nm}$
  133. & FESH0700\\
  134. F-Emiss
  135. & Quad-band bandpass Filter
  136. & Fluorophore emission filtering
  137. & $\lambda_{centr}: \SIlist{446;510;581;703}{\nm}$
  138. & FF01-446/510/581/703\\
  139. F-BlockTwz
  140. & Bandstop filter
  141. & Fluorophore emission filtering
  142. & $\lambda_{centr}: \SIlist{446;510;581;703}{\nm}$
  143. & FF01-446/510/581/703\\
  144. \end{tabular}
  145. \caption{Caption}
  146. \label{tab:my_label}
  147. \end{sidewaystable}
  148. \section{Stabilizzazione meccanica}
  149. \label{sec:stabilization}